changeset 30:c4118dd96310

update usage
author Ken Miyahira <e175733@ie.u-ryukyu.ac.jp>
date Sat, 06 Feb 2021 13:01:53 +0900
parents 7154e9689864
children acbdce4a79d7
files paper/chapter/system_usage.tex paper/file/batch.bash paper/final_thesis.pdf
diffstat 3 files changed, 45 insertions(+), 2 deletions(-) [+]
line wrap: on
line diff
--- a/paper/chapter/system_usage.tex	Fri Feb 05 20:33:39 2021 +0900
+++ b/paper/chapter/system_usage.tex	Sat Feb 06 13:01:53 2021 +0900
@@ -115,7 +115,7 @@
 $ ie-podman registry push [IMAGE_NAME]
 \end{verbatim}
 
-また, registry searchでレジストリに登録されているイメージ一覧を表示することも可能である。
+また, レジストリに登録されているイメージ一覧を表示することも可能である。
 下記の操作でイメージ一覧を表示を行う。
 イメージ名を指定することで, イメージのtag一覧の表示も可能である。
 \begin{verbatim}
@@ -123,4 +123,37 @@
 $ ie-podman registry search [IMAGE_NAME]
 \end{verbatim}
 
-\subsection{SingularityとSlurm}
\ No newline at end of file
+\subsection{GPUを利用した演習}
+新システムでは, 汎用サーバに搭載されるGPUをコンテナから利用できる。
+コンテナからGPUの利用は, PodmanとSingularityの両方から可能である。
+だが, プログラムの実行にはSlurmにJobとして投下する必要がある。
+そのため, イメージを単一ファイルベースとして扱え, ユーザのホームディレクトリがコンテナにマウントされるSingularityを主に利用する。
+%プログラムを実行する環境のみをsifファイルとして構築し, 実行するプログラム, データをホームディレクトリで管理することが可能である。
+Singularityのコンテナの実行には, 下記の操作で行える。
+また, 実行時に--nvオプションを指定することで, コンテナからGPUを利用することが可能になる。
+\begin{verbatim}
+$ singularity run --nv [SIF_NAME]
+\end{verbatim}
+
+実行にはrun, exec, shellのサブコマンドがあり, runではsifファイルを作成する際に指定が可能なrunscriptが実行される。
+指定されない場合はshellが起動する。また, execではイメージ内にインストールされている任意のコマンドを実行することが可能である。
+これらのサブコマンドを利用し, SlurmにJobを投下する際のbatchファイルを作成する。
+batchファイルはソース\ref{pg:batch}の2$\sim$8行目ように, Jobに必要なリソースを定義する。
+リソースの定義後に, 実行したい処理を記述する。
+\lstinputlisting[language=Bash, numbers=left, breaklines=true, basicstyle=\ttfamily\footnotesize, frame=single, caption=batchファイル, label=pg:batch]{file/batch.bash}
+
+batchファイルを作成後, 下記の操作でJobを投下することが可能である。
+\begin{verbatim}
+$ sbatch [BATCH_FILENAME]
+\end{verbatim}
+
+また, Jobの各種情報は, 下記の操作で表示することが可能である。
+\begin{verbatim}
+$ squeue
+\end{verbatim}
+
+投下したJobを停止するには, 下記の操作で行うことができる。
+SlurmはユーザごとにJobが管理されるため, 他ユーザのJobを停止するこはできない。
+\begin{verbatim}
+$ scansel [JOB_ID]
+\end{verbatim}
\ No newline at end of file
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/paper/file/batch.bash	Sat Feb 06 13:01:53 2021 +0900
@@ -0,0 +1,10 @@
+#/bin/bash
+#SBATCH --job-name sample
+#SBATCH --output logs/%x-%j.log
+#SBATCH --error logs/%x-%j.err
+#SBATCH --nodes 1
+#SBATCH --cpus-per-task 8
+#SBATCH --gpus tesla:1
+#SBATCH --time 01:00
+
+singularity exec --nv [SIF_NAME] [COMMANDS]
\ No newline at end of file
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