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author suruga
date Sat, 17 Feb 2018 23:33:14 +0900
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--- a/paper/final_main/chapter2.tex	Sat Feb 17 22:06:31 2018 +0900
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@@ -14,9 +14,26 @@
 Jungleはデータの変更を非破壊で行なっており、編集ごとのデータをバージョンとしてTreeOperationLogに残している。Jungleの分散ノード間の通信は木の変更のTreeOperationLogを交換することによって、分散データベースを構成するよう設計されている。
 
 \section{分散機構}
-Jungleの分散機構は、木構造、すなわちツリー型を想定したネットワークトポロジーを形成し、サーバー同士を接続することで通信を行なっている。
+Jungleの分散機構は、木構造、すなわちツリー型を想定したネットワークトポロジーを形成し、サーバー同士を接続することで通信を行なっている。ツリー型であれば、データの整合性をとる場合、一度トップまでデータを伝搬させることで行える。トップまたはトップまでの間にあるサーバーノードでデータを運搬中に衝突が発生したらMergeを行い、その結果を改めて伝搬すればよいからである(図\ref{fig:tree}）。
+
+\begin{figure}[htbp]
+    \centering
+    \includegraphics[width=100mm]{pic/tree.pdf}
+    \caption{ツリー型のトポロジー}
+    \label{fig:tree}
+\end{figure}
+
+(図\ref{fig:tree}）の矢印の流れを以下に示す。
+\begin{enumerate}
+ \item servernode 1, servernode 2からきたデータがservernode 0 で衝突。
+ \item 衝突したデータのMergeが行われる。
+ \item Mergeされたデータがservernode 1,servernode 2へ伝搬
+ \item servernode1からMergeされたデータがservernode 3、servernode 4へ伝搬。全体でデータの整合性が取れる。
+\end{enumerate}
+
+
 リング型(図\ref{fig:ring} ）やメッシュ型(図\ref{fig:mesh} ）のトポロジーでは、データの編集結果を他のサーバーノードに流す際に、流したデータが自分自身に返ってくることでループが発生してしまう可能性がある。
-ツリー型であれば、閉路がない状態でサーバーノード同士を繋げることができる為、編集履歴の結果を他のサーバーノードに流すだけですみ、結果ループを防ぐことができる(図\ref{fig:tree}）。
+ツリー型であれば、閉路がない状態でサーバーノード同士を繋げることができる為、編集履歴の結果を他のサーバーノードに流すだけですみ、結果ループを防ぐことができる。
 
 \begin{figure}[htbp]
     \centering
@@ -32,13 +49,6 @@
     \label{fig:mesh}
 \end{figure}
 
-\begin{figure}[htbp]
-    \centering
-    \includegraphics[width=100mm]{pic/tree.pdf}
-    \caption{ツリー型のトポロジー}
-    \label{fig:tree}
-\end{figure}
-
 ネットワークトポロジーは、当研究室で開発している並列分散フレームワークであるAliceが提供する、TopologyManagerという機能を用いて構成されている。
 
 また、データ分散の為には、どのデータをネットワークに流すのか決めなければならない。そこで、TreeOperationLogを使用する。前セクションでも述べたが、TreeOperationLogには、どのNodeにどのような操作をしたのかという、データ編集の履歴情報が入っている。
--- a/paper/final_main/chapter3.tex	Sat Feb 17 22:06:31 2018 +0900
+++ b/paper/final_main/chapter3.tex	Sat Feb 17 23:33:14 2018 +0900
@@ -37,7 +37,7 @@
 そこで、本研究ではJava版のJungleにおいて、Webサーバーを取り除いた、純粋なJungleの性能を測定するプログラムを実装した。
 
 \section{測定環境}
-
+本実験では、
 \section{TORQUE Resource Manager}
 分散環境上でのJungleの性能を測定するにあたり、VM32台にJungle,AliceのTopologyManagerを起動させた後、Jungleを立ち上げたVMでデータを書き込むプログラムを動作させる。プログラムを起動する順番やタイミングは、TORQUE Resource Managerというジョブスケジューラーによって管理する。
 
@@ -56,7 +56,48 @@
 今回、ジョブには、使用するVMの数や、実行させたいテストプログラムの参照先等を記述している。
 \newpage
 
-\section{Jungleの分散性能測定用テストプログラム}
+\section{分散フレームワーク Alice による分散環境の構築}
+本研究では、分散環境上でのJungleの性能を確認する為、VM32台分のサーバーノードを用意し、それぞれでJungleを起動することで、Jungle間で通信をする環境をつくる。
+Jungleを起動したサーバーノード間の通信部分を、当研究室で開発している並列分散フレームワークAlice[1]にて再現する。
+
+Aliceには、ネットワークのトポロジーを構成するTopologyManager[2]という機能が備わっている。サーバーノードはTopologyManagerに、誰に接続を行えばよいかを尋ねる。TopologyManagerは尋ねてきたサーバーノードに順番に、接続先のサーバーノードのIPアドレス、ポート番号、接続名を送り、受け取ったサーバーノードはそれらに従って接続する。
+この時、TopologyManager自身はVM0を用いて立ち上げる。
+よって、TopologyManagerはJungleをのせたVM1からVM32、計VM31台分のサーバーノードを、木構造を形成するように采配する（図\ref{fig:topologymanager} ）。
+
+\begin{figure}[H]
+    \centering
+    \includegraphics[width=100mm]{pic/topologymanager3.pdf}
+    \caption{AliceによるJungleの木構造トポロジーの形成}
+    \label{fig:topologymanager}
+\end{figure}
+
+%DataSegment CodeSegment
+Aliceはタスクを行うCodeSegmentと、CodeSegmentで使用するデータを扱うDataSegmentによってプログラムを行うスタイルを取る。
+CodeSegmentはDataSegmentが必要なデータを受け取り次第、タスクを行う。DataSegmentがデータを受け取る為には、そのDataSegmentを示すキーが必要である。
+
+TopologyManagerによって構成されたトポロジーのサーバーノードには、それぞれ自分自身を示す文字列であるキーが存在する。
+このキーは自身のサーバーノードのDataSegmentがデータを受け取る際に指定する必要がある。
+
+たとえば、servernode0,servernode1,servernode２により、(図\ref{fig:LogupdateTree})のように木構造が構成されたとする。
+\begin{figure}[H]
+    \centering
+    \includegraphics[width=100mm]{pic/LogupdateTree.pdf}
+    \caption{トポロジーの形成}
+    \label{fig:LogupdateTree}
+\end{figure}
+
+この時、servernode0はservernode１、servernode2に対して親にあたる。逆に、servernode1,servernode２はservernode0に対して子にあたる。よって、(図\ref{fig:LogupdateTree})に矢印の隣にかかれている文字列"parent","child 1","child 2"のようにキーを指定している。
+servernode0からservernode1へデータを送りたい場合、”child 1”というキーを追加すればいい。
+このように、データアクセスしたいサーバーノードのキーを追加することで、そのサーバノードのDataSegmentへデータアクセスすることができる。
+他のサーバーノードのDataSegmentへデータアクセスする際には、アクセス先のサーバーノードのキーを追加すればいい。
+
+%TreeOperationLog
+トポロジー構成後、Jungle間の通信でのデータ形式にはTreeOperationLogを利用する。TreeOperationLogは、Jungleによるノードの編集の履歴などの情報が入っている。TreeOperationLogは、AliceのDataSegmentでも扱えるようシリアライズ化されたデータである。よって、Aliceによって構成されたネットワークトポロジーのサーバノード間でのデータのアクセスが可能になっている。
+TreeOperationLogをAliceによって他のJungleへ送る。送信先のJungleでは、送られてきたTreeOperationLogを参照して送信元のJungleと同じノード編集を行う。こうして、Jungle間でのデータの同期を可能にしている。
+\newpage
+
+\section{Jungleの分散性能測定用テストプログラムの実装}
+本実験において、Jungleの性能を測定する為にテストプログラムを作成した。
 テストプログラムは、木構造における子ノードに、データを複数書き込む機能を提供する。
 末端の複数の子ノードにデータをそれぞれ書き込み、最終的にrootノードへデータをmergeしていく(図\ref{fig:logupdatetest} ）。データを複数書き込む機能は、Jungleを立ち上げる際に-writeオプションと-countオプションをつけることで搭載される。
 
@@ -103,43 +144,3 @@
 % ssh $nodes[$i] \"cd $logFile;java -jar ../../build/libs/logupdateTest-1.1.jar -host $nodes[0] -p 10003 -port 10000  --noKeepAlive
 \end{lstlisting}
 
-\section{分散フレームワーク Alice による分散環境の構築}
-本研究では、分散環境上でのJungleの性能を確認する為、VM32台分のサーバーノードを用意し、それぞれでJungleを起動することで、Jungle間で通信をする環境をつくる。
-Jungleを起動したサーバーノード間の通信部分を、当研究室で開発している並列分散フレームワークAlice[1]にて再現する。
-
-Aliceには、ネットワークのトポロジーを構成するTopologyManager[2]という機能が備わっている。TopologyManagerに参加表明をしたサーバーノードに順番に、接続先のサーバーノードのIPアドレス、ポート番号、接続名を送り、受け取ったサーバーノードはそれらに従って接続する。
-この時、TopologyManager自身はVM0を用いて立ち上げる。
-よって、TopologyManagerはJungleをのせたVM1からVM32、計VM31台分のサーバーノードを、木構造を形成するように采配する（図\ref{fig:topologymanager} ）。
-
-\begin{figure}[H]
-    \centering
-    \includegraphics[width=100mm]{pic/topologymanager_2.pdf}
-    \caption{AliceによるJungleの木構造トポロジーの形成}
-    \label{fig:topologymanager}
-\end{figure}
-
-%DataSegment CodeSegment
-Aliceはタスクを行うCodeSegmentと、CodeSegmentで使用するデータを扱うDataSegmentによってプログラムを行うスタイルを取る。
-CodeSegmentはDataSegmentが必要なデータを受け取り次第、タスクを行う。DataSegmentがデータを受け取る為には、そのDataSegmentを示すキーが必要である。
-
-TopologyManagerによって構成されたトポロジーのサーバーノードには、それぞれ自分自身を示す文字列であるキーが存在する。
-このキーは自身のサーバーノードのDataSegmentがデータを受け取る際に指定する必要がある。
-
-たとえば、servernode0,servernode1,servernode２により、(図\ref{fig:LogupdateTree})のように木構造が構成されたとする。
-\begin{figure}[H]
-    \centering
-    \includegraphics[width=100mm]{pic/LogupdateTree.pdf}
-    \caption{トポロジーの形成}
-    \label{fig:LogupdateTree}
-\end{figure}
-
-この時、servernode0はservernode１、servernode2に対して親にあたる。逆に、servernode1,servernode２はservernode0に対して子にあたる。よって、(図\ref{fig:LogupdateTree})に矢印の隣にかかれている文字列"parent","child 1","child 2"のようにキーを指定している。
-servernode0からservernode1へデータを送りたい場合、”child 1”というキーを追加すればいい。
-このように、データアクセスしたいサーバーノードのキーを追加することで、そのサーバノードのDataSegmentへデータアクセスすることができる。
-他のサーバーノードのDataSegmentへデータアクセスする際には、アクセス先のサーバーノードのキーを追加すればいい。
-
-%TreeOperationLog
-トポロジー構成後、Jungle間の通信でのデータ形式にはTreeOperationLogを利用する。TreeOperationLogは、Jungleによるノードの編集の履歴などの情報が入っている。TreeOperationLogは、AliceのDataSegmentでも扱えるようシリアライズ化されたデータである。よって、Aliceによって構成されたネットワークトポロジーのサーバノード間でのデータのアクセスが可能になっている。
-TreeOperationLogをAliceによって他のJungleへ送る。送信先のJungleでは、送られてきたTreeOperationLogを参照して送信元のJungleと同じノード編集を行う。こうして、Jungle間でのデータの同期を可能にしている。
-\newpage
-
--- a/paper/final_main/main.aux	Sat Feb 17 22:06:31 2018 +0900
+++ b/paper/final_main/main.aux	Sat Feb 17 23:33:14 2018 +0900
@@ -10,12 +10,12 @@
 \@writefile{lot}{\addvspace {10\p@ }}
 \@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {2.1}Jungleデータベースの構造}{3}}
 \@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {2.2}分散機構}{3}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.1}{\ignorespaces ring型のトポロジー}}{4}}
-\newlabel{fig:ring}{{2.1}{4}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.2}{\ignorespaces メッシュ型のトポロジー}}{4}}
-\newlabel{fig:mesh}{{2.2}{4}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.3}{\ignorespaces ツリー型のトポロジー}}{5}}
-\newlabel{fig:tree}{{2.3}{5}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.1}{\ignorespaces ツリー型のトポロジー}}{4}}
+\newlabel{fig:tree}{{2.1}{4}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.2}{\ignorespaces ring型のトポロジー}}{5}}
+\newlabel{fig:ring}{{2.2}{5}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {2.3}{\ignorespaces メッシュ型のトポロジー}}{5}}
+\newlabel{fig:mesh}{{2.3}{5}}
 \@writefile{toc}{\contentsline {chapter}{\numberline {第3章}評価実験}{6}}
 \@writefile{lof}{\addvspace {10\p@ }}
 \@writefile{lot}{\addvspace {10\p@ }}
@@ -26,20 +26,20 @@
 \@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {3.3}TORQUE Resource Manager}{7}}
 \@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {3.1}{\ignorespaces TORQUEの構成}}{7}}
 \newlabel{fig:torque}{{3.1}{7}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {3.4}Jungleの分散性能測定用テストプログラム}{8}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {3.2}{\ignorespaces TestプログラムによるJungleの性能測定}}{8}}
-\newlabel{fig:logupdatetest}{{3.2}{8}}
-\newlabel{src:Logupdate.pl}{{3.1}{8}}
-\@writefile{lol}{\contentsline {lstlisting}{\numberline {3.1}Alice によるネットワークトポロジーマネージャーの起動}{8}}
-\newlabel{src:WriteCount}{{3.2}{9}}
-\@writefile{lol}{\contentsline {lstlisting}{\numberline {3.2}writeモードでのJungleの起動}{9}}
-\newlabel{src:jungle}{{3.3}{9}}
-\@writefile{lol}{\contentsline {lstlisting}{\numberline {3.3}Jungleの起動}{9}}
-\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {3.5}分散フレームワーク Alice による分散環境の構築}{9}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {3.3}{\ignorespaces AliceによるJungleの木構造トポロジーの形成}}{10}}
-\newlabel{fig:topologymanager}{{3.3}{10}}
-\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {3.4}{\ignorespaces トポロジーの形成}}{11}}
-\newlabel{fig:LogupdateTree}{{3.4}{11}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {3.4}分散フレームワーク Alice による分散環境の構築}{8}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {3.2}{\ignorespaces AliceによるJungleの木構造トポロジーの形成}}{8}}
+\newlabel{fig:topologymanager}{{3.2}{8}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {3.3}{\ignorespaces トポロジーの形成}}{9}}
+\newlabel{fig:LogupdateTree}{{3.3}{9}}
+\@writefile{toc}{\contentsline {section}{\numberline {3.5}Jungleの分散性能測定用テストプログラムの実装}{10}}
+\@writefile{lof}{\contentsline {figure}{\numberline {3.4}{\ignorespaces TestプログラムによるJungleの性能測定}}{10}}
+\newlabel{fig:logupdatetest}{{3.4}{10}}
+\newlabel{src:Logupdate.pl}{{3.1}{10}}
+\@writefile{lol}{\contentsline {lstlisting}{\numberline {3.1}Alice によるネットワークトポロジーマネージャーの起動}{10}}
+\newlabel{src:WriteCount}{{3.2}{11}}
+\@writefile{lol}{\contentsline {lstlisting}{\numberline {3.2}writeモードでのJungleの起動}{11}}
+\newlabel{src:jungle}{{3.3}{11}}
+\@writefile{lol}{\contentsline {lstlisting}{\numberline {3.3}Jungleの起動}{11}}
 \@writefile{toc}{\contentsline {chapter}{\numberline {第4章}性能評価}{12}}
 \@writefile{lof}{\addvspace {10\p@ }}
 \@writefile{lot}{\addvspace {10\p@ }}
Binary file paper/final_main/main.dvi has changed
--- a/paper/final_main/main.lof	Sat Feb 17 22:06:31 2018 +0900
+++ b/paper/final_main/main.lof	Sat Feb 17 23:33:14 2018 +0900
@@ -1,12 +1,12 @@
 \addvspace {10\p@ }
 \addvspace {10\p@ }
-\contentsline {figure}{\numberline {2.1}{\ignorespaces ring型のトポロジー}}{4}
-\contentsline {figure}{\numberline {2.2}{\ignorespaces メッシュ型のトポロジー}}{4}
-\contentsline {figure}{\numberline {2.3}{\ignorespaces ツリー型のトポロジー}}{5}
+\contentsline {figure}{\numberline {2.1}{\ignorespaces ツリー型のトポロジー}}{4}
+\contentsline {figure}{\numberline {2.2}{\ignorespaces ring型のトポロジー}}{5}
+\contentsline {figure}{\numberline {2.3}{\ignorespaces メッシュ型のトポロジー}}{5}
 \addvspace {10\p@ }
 \contentsline {figure}{\numberline {3.1}{\ignorespaces TORQUEの構成}}{7}
-\contentsline {figure}{\numberline {3.2}{\ignorespaces TestプログラムによるJungleの性能測定}}{8}
-\contentsline {figure}{\numberline {3.3}{\ignorespaces AliceによるJungleの木構造トポロジーの形成}}{10}
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+\contentsline {figure}{\numberline {3.2}{\ignorespaces AliceによるJungleの木構造トポロジーの形成}}{8}
+\contentsline {figure}{\numberline {3.3}{\ignorespaces トポロジーの形成}}{9}
+\contentsline {figure}{\numberline {3.4}{\ignorespaces TestプログラムによるJungleの性能測定}}{10}
 \addvspace {10\p@ }
 \addvspace {10\p@ }
--- a/paper/final_main/main.log	Sat Feb 17 22:06:31 2018 +0900
+++ b/paper/final_main/main.log	Sat Feb 17 23:33:14 2018 +0900
@@ -1,4 +1,4 @@
-This is e-pTeX, Version 3.14159265-p3.7.1-161114-2.6 (utf8.euc) (TeX Live 2017) (preloaded format=platex 2017.10.20)  17 FEB 2018 21:59
+This is e-pTeX, Version 3.14159265-p3.7.1-161114-2.6 (utf8.euc) (TeX Live 2017) (preloaded format=platex 2017.10.20)  17 FEB 2018 23:31
 entering extended mode
  restricted \write18 enabled.
  %&-line parsing enabled.
@@ -605,28 +605,28 @@
 
 ]) (./chapter2.tex [2]
 第 2 章
+File: pic/tree.pdf Graphic file (type pdf)
+<pic/tree.pdf> [3
+
+]
 File: pic/ring.pdf Graphic file (type pdf)
-<pic/ring.pdf>
+ <pic/ring.pdf>
 File: pic/mesh.pdf Graphic file (type pdf)
- <pic/mesh.pdf>
-File: pic/tree.pdf Graphic file (type pdf)
- <pic/tree.pdf> [3
-
-] [4]) (./chapter3.tex [5]
+ <pic/mesh.pdf>) (./chapter3.tex [4] [5]
 第 3 章
 [6
 
 ]
 File: ./pic/torque.pdf Graphic file (type pdf)
  <./pic/torque.pdf> [7]
-File: pic/logupdatetest2.pdf Graphic file (type pdf)
- <pic/logupdatetest2.pdf> [8]
-File: pic/topologymanager_2.pdf Graphic file (type pdf)
+File: pic/topologymanager3.pdf Graphic file (type pdf)
+ <pic/topologymanager3.pdf> [8]
+File: pic/LogupdateTree.pdf Graphic file (type pdf)
 
-<pic/topologymanager_2.pdf> [9]
-File: pic/LogupdateTree.pdf Graphic file (type pdf)
- <pic/LogupdateTree.pdf> [10] [11])
-(./chapter4.tex
+<pic/LogupdateTree.pdf> [9]
+File: pic/logupdatetest2.pdf Graphic file (type pdf)
+ <pic/logupdatetest2.pdf> [10]) (./chapter4.tex
+[11]
 第 4 章
 [12
 
@@ -645,11 +645,11 @@
  ) 
 Here is how much of TeX's memory you used:
  4030 strings out of 493653
- 49024 string characters out of 6148873
- 146919 words of memory out of 5000000
+ 49021 string characters out of 6148873
+ 163921 words of memory out of 5000000
  7534 multiletter control sequences out of 15000+600000
  16433 words of font info for 66 fonts, out of 8000000 for 9000
  929 hyphenation exceptions out of 8191
  27i,7n,32p,520b,1156s stack positions out of 5000i,500n,10000p,200000b,80000s
 
-Output written on main.dvi (19 pages, 44252 bytes).
+Output written on main.dvi (19 pages, 45712 bytes).
--- a/paper/final_main/main.lol	Sat Feb 17 22:06:31 2018 +0900
+++ b/paper/final_main/main.lol	Sat Feb 17 23:33:14 2018 +0900
@@ -1,3 +1,3 @@
-\contentsline {lstlisting}{\numberline {3.1}Alice によるネットワークトポロジーマネージャーの起動}{8}
-\contentsline {lstlisting}{\numberline {3.2}writeモードでのJungleの起動}{9}
-\contentsline {lstlisting}{\numberline {3.3}Jungleの起動}{9}
+\contentsline {lstlisting}{\numberline {3.1}Alice によるネットワークトポロジーマネージャーの起動}{10}
+\contentsline {lstlisting}{\numberline {3.2}writeモードでのJungleの起動}{11}
+\contentsline {lstlisting}{\numberline {3.3}Jungleの起動}{11}
Binary file paper/final_main/main.pdf has changed
--- a/paper/final_main/main.toc	Sat Feb 17 22:06:31 2018 +0900
+++ b/paper/final_main/main.toc	Sat Feb 17 23:33:14 2018 +0900
@@ -8,8 +8,8 @@
 \contentsline {section}{\numberline {3.1}実験目的}{6}
 \contentsline {section}{\numberline {3.2}測定環境}{7}
 \contentsline {section}{\numberline {3.3}TORQUE Resource Manager}{7}
-\contentsline {section}{\numberline {3.4}Jungleの分散性能測定用テストプログラム}{8}
-\contentsline {section}{\numberline {3.5}分散フレームワーク Alice による分散環境の構築}{9}
+\contentsline {section}{\numberline {3.4}分散フレームワーク Alice による分散環境の構築}{8}
+\contentsline {section}{\numberline {3.5}Jungleの分散性能測定用テストプログラムの実装}{10}
 \contentsline {chapter}{\numberline {第4章}性能評価}{12}
 \contentsline {section}{\numberline {4.1}java版jungleとhuskell版jungleの比較}{12}
 \contentsline {section}{\numberline {4.2}java版jungleの分散性能の評価}{12}
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